在項目預算管理中，部門預算的各個環(huán)節(jié)都是緊緊相扣，缺一不可的，在部門預算的整個過程中，要保證預算各環(huán)節(jié)的連續(xù)性，以達到部門預算的建立有效公共財政體制的目的。預算管理是指企業(yè)在戰(zhàn)略目標的指導下，對未來的經營活動和相應財務結果進行充分、全面的預測和籌劃，并通過對執(zhí)行過程的監(jiān)控，將實際完成情況與預算目標不斷對照和分析，從而及時指導經營活動的改善和調整，以幫助管理者更加有效地管理企業(yè)和最大程度地實現(xiàn)戰(zhàn)略目標。總結來看，項目預算管理有以下主要特點。
（一）科學合理性
1.預算收支規(guī)模的預測和方向要科學。首先收支預測要與國民經濟社會發(fā)展狀況相適應，要有利于促進國民經濟協(xié)調健康、可持續(xù)發(fā)展，同時要結合本單位自身收入來源和能力，考慮自身實際的支出需求和結構，合理穩(wěn)妥地預計收入，安排支出，做到收支平衡，不得編制赤字預算。
2.預算編制要科學。首先合理安排預算編制程序和時間，保證充裕的時間編制預算，保證預算編制質量，提高預算編制的效率；其次，預算編制的方法要科學，預算的編制要制定科學規(guī)范的方法，測算的過程要有理有據(jù)；第三，預算的核定要科學，基本支出預算定額要依照科學的方法制定，項目支出預算編制中要對項目進行遴選，分輕重緩急排序，科學合理地選擇項目。
3.預算要有前瞻性。在編制過程中要充分考慮項目單位自身在預算年度需求、支出內容和結構，保證預算在執(zhí)行過程中的可行性和可操作性。避免出現(xiàn)預算與執(zhí)行差距過大的問題，使預算失去其控制支出、考評執(zhí)行情況的實際意義。
（二）客觀真實性
收支的預測須以國家社會經濟發(fā)展計劃和履行部門職能的需要為依據(jù)，對收支項目的數(shù)字指標應認真測算，力求各項收支數(shù)據(jù)真實準確。機構、編制、人員、資產等基礎數(shù)據(jù)資料要按實際情況填報；收入預算要結合近幾年實際取得的收入并考慮增收減收因素測算，不能隨意夸大或隱瞞收入；支出要按規(guī)定的標準，結合近幾年實際支出情況測算，不得隨意虛增或虛列支出；各項收支要符合部門的實際情況，測算時要有真實可靠的依據(jù)，不能憑主觀印象或人為提高開支標準編制預算。
（三）系統(tǒng)完整性
所有收入和支出全部納入部門預算，各種預算外資金要嚴格執(zhí)行“收支兩條線”管理，改變預算內外資金 “兩張皮”的狀況，取消收支掛鉤的預算核定方法，對單位的預算內、外各項財政資金和其他收入，統(tǒng)一管理，統(tǒng)籌安排，統(tǒng)一編制綜合財政預算。編制預算時，要將部門依法取得的包括所有財政性資金在內的各項收入以及相應的支出作為一個有機整體進行管理，對各項收入、支出預算的編制做到不重不漏，不得在部門預算之外保留其他收支項目。對各項收入支出在執(zhí)行中要嚴格按照國家、財政部規(guī)定的各項收支政策進行管理。
（四）合法合規(guī)性
部門預算首先要符合《憲法》、《預算法》等法律法規(guī)的要求。部門預算的各項收支要充分體現(xiàn)國家有關方針、政策，并在法律賦予部門的職能范圍內編制。具體來講：一是收入要合法合規(guī)。組織基金收入要符合國家法律、法規(guī)的規(guī)定，行政事業(yè)性收費要按財政部、國家發(fā)改委和價格管理部門核定的收費項目和標準測算等。二是各項支出要符合財政宏觀調控的目標，要遵守現(xiàn)行的各項財務規(guī)章制度。
（五）公開透明性
對于單位的經常性支出，要通過建立科學的定員定額體系，以實現(xiàn)預算分配的標準化。對于部門為完成特定行政工作任務或事業(yè)發(fā)展而發(fā)生的各類項目支出，要通過填報項目文本、建立項目庫、科學論證，采用擇優(yōu)排序的方法確定必保項目和備選項目，結合當年的財力狀況與財政支出重點，優(yōu)先安排急需、可行的項目